Aslında pokémon dünyası bizimkine çok benziyor: aradaki tek fark o dünyanın pokémon adındaki fantastik yaratıklarla dolu olması. Bu dünyadaki bazı insanlar pokémon yetiştiricileri olmaya karar verir.

150 çeşit farklı pokémon vardır. Bir yetiştiricinin görevi olabildiğince çok pokemon yakalamak ve onları eğitmektir. Her farklı pokémon’un farklı güçleri ve farklı yetenekleri vardır. Bir pokémon’u iyi yetiştirebilmek için cesur , azimli ve sevecen olmak gerekir. Bir yetiştiricinin pokémon’u büyüdükçe güçlenecek, yeni ataklar öğrenecek ve hatta bazen yeni, farklı bir pokemon’a bile dönüşebilecektir.

Pokémon kart oyununu 2 kişi arasında oynanır. Bir oyun iki yetiştirici arasındaki bir karşılaşmayı temsil eder. Her oyuncunun kendine ait 60 karttan oluşan bir destesi vardır.
Her yetiştirici kartlardaki farklı numaraları ve taktikleri oyunda kullanır.
Bu kartların, piyasadaki diğer kartlardan farkı, sadece bu kartlarla Pokémon kart oyununun oynanabilmesi. Oysa diğer kartlar sadece biriktirmeye yönelik. Standart bir kart oyunuyla pokémon gibi bir değiş tokuş kart oyunu arasındaki en büyük fark ise, pokémon’da her oyuncunun kendine özel destesini yapabilmesi. Bir sürü farklı kart olduğundan, bir oyuncu elindeki kartlardan yeni bir deste oluşturabilir. Zaten oyunun zevki, farklı temaları temsil eden veya farklı stratejiler deneyebileceğiniz farklı desteler oluşturmak.
Çocuklar genellikle koleksiyonlarını tamamlamak veya desteleri için gerekli kartları alabilmek için kendi aralarında pokémon kartı değiş tokuşu yapar. Eğer az bulunan kartlar hakkında bilgi sahibi olursanız, çocuğunuzun daha iyi değiş tokuşlar yapmasına yardımcı olabilirsiniz.

Alev topu beyaz bir ışıkla gökyüzünü aydınlattı. Ash rüzgarın kuvvetiyle geri doğru fırladı. Sersemlemişti, rüzgarın gücü şimşekten de kuvvetliydi. Havayi fişeklerden bile kuvvetli. Buna inanamıyordu. Ash arkasına baktı. Pikachu yanıbaşında yatıyordu.
Üzerlerindeki bulutlar yokoldu. Güneş parıldamaya başladı. Artık görülebilecek bir Spearow yoktu.
"Onları yendik," dedi Ash bitkin bir halde.
"Chuu," diye yanıtladı Pikachu. Pikachu hayattaydı ama yaralanmış görünüyordu. Ash sorunlarının henüz bitmediğinin farkındaydı. Pikachu’yu geç olmadan Pikachu merkezine götürmeliydi.
Ash Misty nin bisikletine baktı. Metal, patlamadan dolayı kömürleşmiş, kapkaraydı. Yürüyerek gitmek zorundaydılar. Ash Yolun aşağısında Viridian City nin binalarını görebiliyordu.Bunu yapabilirdi ama acale etmesine gerek yoktu. Ash Pikachu yu sırtına alarak koştu. 
Ağaçlar yolun kenarında boylu boyunca uzanıyordu. Önlerinde ise bi patika vardı. Başarmışlardı! Yaklaştıkça bir siren sesi havada yankılandı. 
"Virdan City vatandaşlarının dikkatine!" diye bir ses duyuldu güçlü bir mikrofondan. "bölgemizde Pokemon hırsızlarının olabileceği haberini aldık. Şüpheli yabancı şahıslara karşı hazırlıklı olun."
Pokemon hırsızları mı? Tehlikeli gibi gözüküyor, diye düşündü Ash. Ama duracak vakti yoktu. Pikachu nun yardıma ihtiyacı vardı hemen. 
Ash Virdan City nin sokaklarını hızla geçti. Kubbe şeklinde,ön cephesinde kırmızı bir "p"si olan bir bina hayal gibi karşında beliriverdi.
"Pokemon merkezi!" diye haykırdı Ash. "Bu dev gibi" Ash ön kapıya dayandı. "Lütfen Pikachu ma yardım edin," dedi standın ardındaki hemşireye.
Hemşire piakchu ya bir göz attıktan sonra bilgisayarda bişeyler yazmaya başladı. "Bir pokemon için bir sedyeye ihtiyacım var" diye emreti hemşire. Acilin kapısı açıldı ve hemşire kepi giyen iki pembe pokemon sedyeyi iterek geldiler. Zavallı pikachunun çok canı yanıyor gibiydi. Ash, hemşire onu götrürken zar zor bakabildi. Hemşire omzuna dokudu. Kırmızı saçları iki yandan örgülüydü ve Ash onun çok tatlı bir yüzü olduğunu düşündü. " O iyi olacak. Ona çok iyi bakacağız. Chansey pokemonlar çok iyi hemşirelerdir. Benim adım Joy. Sen kimsin?"
"Benim adım Ash, Pikachu nun eğitmeniyim." Dedi Ash.
Joy un ifadesi değişti. " Umarım ilerde daha sorumlu olursun Ash. Bu durumdayken bir pokemon savaşına izin vermemelisin." 
Ash Joy un haklı olduğunu biliyordu. Joy iki sürme kapının arkasında durdu.
"Ash bekleme odasına gitmen gerkecek." Dedi.
"Ama ben " diye başlamıştı ki kapılar önünde kapandı. Ash bekleme odasına geçti. Video ekranlı telefonlar duvarda sıralıydı. Onlardan biri çalıyordu.
Ash çalan telefonun ekranına dokununca Profesör oak ın yüzü ekranda belirdi.
"Ah Ash Viridian City ye ulaşmış olacağını umuyordum" dedi Prof.Oak. "Pallet ten olan bütün eğitmenler orda; senin bu kadar kısa zamanda varman beni şaşırttı doğrusu.
Ash in yüzü kızardı. Prof.Oak devam etti.
"Aslında torunum Gary oraya gittiğinde başka yeni bir Pokemonun kalmayacağını düşünmüş ben de onun yanılacağı üzerine 1 milyon dolara bahse girmiştim!"
Ash kızarmıştı "Para herşey değildir öyle değil mi?"
"Oh neden umursayayım ki?" dedi Prof.Oak. Bir zil sesi duyulmasının ardından "Ash gitmem gerek. pizzam gelmiş" Ekran karardı.
Ne iğrenç gün diye düşündü Ash. Pokemonum yaralandı, Gary Oak beni burda yendi. Prof.Oak benim yenik olduğumu düşünüyor. Daha başka ne terslik olabilirdi ki?
"Seni burda bulacağımı biliyordum!"
Ash kızgın sesin geldiği yöne doğru döndü. Bu Misty di. Yanmış bisikletini sırtında taşıyordu. Ash bir sandalyeye yığılıverdi. Bunlar çok fazlaydı artık.
"Uygun bir zamanda tamir edeceğim" dedi Ash.  
"Ama şu an pikachumla ilgilenmeliyim" Misty nin yüzü yumuşadı. "İyi mi?"
Acilin kapısı açıldı. Joy ve iki Chansey Pokemonu sedyeyle pikachuyu götürüyorlardı. Pikachunun başı sarılmıştı. Bir de ampul görünüyordu. Başlığından tekerleklere doğu teller bağlanmıştı.
Ash Pikachu nun yanına koştu. 
"İyi misin?" diye sordu. Pikachu nun gözleri kapalıydı. Cevap vermedi. "Herşey yolunda gitti, Pikachunuz iyi olacak" dedi Joy.
Ash bir nefes verip rahatladı "Çok teşekkür ederim! Belki de herşey iyiye gidiyor nihayet" Ash pokemon merkezinde yankılanan siren sesiyle yerinden fırladı. 
"Viridian city nin dikkatine" diye bir ses duyuldu megafondan. "Pokemon hırsızlarına ait bir uçak saptanmıştır." "Ee şimdi ne yapıyoruz " diye sordu Ash.
Kükreyen bir ses sorusuna yanıt verdi. 
Ash yukarı baktı; iki poke topu Pokemon merkezinin cam tavanına çarpmıştı.
Kalın yeşil bir duman bulutu bekleme odasını kapladı. Ash dumanda boğulacak gibi oldu. Zehirli gibi kokuyordu. Saldırıya uğramışlardı

Hikaye dünyanın en nadir bulunan,en esrarengiz Pokemon olan Lugia’yı yakalama soruşturmasını üstlenen Pokemon Toplayıcısı Jirarudan’a başlar. Lugia daha önce hiçbir insan tarafından görülmemiş ama üç Efsanevi Kuş’un Lugia’nın ortaya çıktığı yerde biraraya geldiği yazılmıştır. Bu yüzden Efsanevi Kuş’ların kendi adası vardır. Biraraya gelecek olursalar sonuç bir felaket olurdu. Jirarudan Moltres’ın bulunduğu Fire Adası’na yaklaşmaya başlar ve adayı buzla dondurarak Moltres’ı yaralar. Jirarudan elektirkli bir ağla Moltres’ı bu güçsüz durumundan faydalanarak yakalamaya çalışır. Jiraru’dan ve uçan kalesi esrarengiz Zpados’u yakalamak için Thunder Adası’na doğru yol alırlar. Aniden hava kötüleşir. Ash, Kenji ve Misty Mic-Chan adlı bir rehber kumandasında Ashia Adası’a gitmektedirler. Gemileri kasırganın tam ortasında çırpınırken Mc-Chan tüm yeteneğini kullanarak gemiyi kıyıya ulaştırır. Ash ve çetesi pokemonları toplarından çıkarıp ayaklarını germelerine izin verirler. Fırtına bile Team Rocket’i onlardan uzak tutmaya yetmezdi; denizaltıları Mecha-Magikarp’ta Ash ve çetesini izliyorlardı. Team Rocket de bir biçimde aynı fırtınaya yakalanırlar ve bir kayaya çarparak denizaltının kontrolünü kaybederler. Suyun üzerinde yüzerken, bir Magikarp okuluna çarpıp kayalara doğru sürüklenirler. Zavallı Team Rocket:-Misty’nin annesi güneşin altında dinlenirken, Pokemon Profesörü Prof.Oak bisikletiyle gelir ve güzel havadan laf açar. Aniden bir grup Diglett’in sokakları ezercesine yürüyüşleri duyulur ve gelip Oak’ın bisikletini alarak güneşin batışına doğru yol aldıkları görülür. Prof.Oak şaşkın bakışlarla Diglettlerin ardından gelen Pokemon sürüsünü görür. Prof.Oak ve Misty’nin annesi şaşkın vaziyette yazın ortasında yağmaya başlayan karı farkederler. Diğer yandan Ash ve arkadaşları Ashia Adasına çıkmışlardır. Hasara uğramış gemiden inerken etrafları garip giyinimli bir çeşit rahip grubuyla sarılır. Rahiplerden biri maskesini çıkarır ve Ash’le arkadaşlarına Pokemon Tanrıları şerefine düzenlenen festivalden söz eder. Ash ve arkadaşları, merasimin Miko’su Furura adlı bir genç kızla tanışırlar. Furura Ash’ten hoşlanmış gibidir ve Misty’ye onun Ash’in kız arkadaşı olup olmadığını sorar. Herkes kumsal boyunca yürüyüp merasimin olacağı yere doğru giderler. Ash kumsalda, bir pokemon eğitmeni olduğunu (Misty’den başka bir tek oydu), Efsanevi Kuşlar’ın adasından güç kritallerini geri almak için seçildiğini anlatır. Fırtınanın havada ve denizdeki etkileri güçlerindeki dengesizlikten ileri gelmiş ve 3 kayayı biraraya getirmek havayı yumuşatabilir gibi görünüyordu.

Hiç bir zaman bir ateş tanrısını, bir kasırga tanrısını ya da bir buz tanrısını yakalama. Denersen öfkelerini uyandırır ve deniz tanrısı Cennet ve Evreni yerler bir eder. Dünya bir harabeye döner.

Ash ve Mc-Chan gemiye binip rotalarını Fire Adasına doğru çevirdiler, fırtına hala hiddetini korurken Team Rocket ’de onların ardından izliyorlardı. Ash adaya ulaşınca gemiden çıkıp güç kristalini bulacağı, Moltres türbesinin bulunduğu dağın merdivenllerini hızla çıkmaya başlar. Fururra ve Misty adaya gitmek için daha iyi bir gemi bulmaya karar verirler. Team Rocket ’de Ash’in hemen ardından merdivenleri çıkmaya başlarlar. Aynı zamanda Fururra’nın gemisi yakaladığı ani bir rüzgarla dağda koca bir delik açar. Tam Ash güç taşını alıp adaya geri dönmeye hazırlanırken efsanevi üç kuştan biri olan Zapados, aniden beliriverir. Zapados korkmuştur ve Moltres’ı aramaktadır. Zapados tek iletişim yolu olan yıldırımlarıyla Ash’e saldırır. Pikachu Zapados’la konuşmayı denemeye karar verir ve havaya yıldırımlar saçarak neden orda olduklarını ve ne bildiklerini anlatmaya çalışır. Pikachuyla Zapados’un diyaloğu Zapados’un elektrik yıldırımlarının gökyüzüne doğru dönmesiyle sona erer. Ash ve Pikachu Jirarudan’n Hikoukyu’suna bakarlar. Zapados’a saldırır ve akranı Moltres gibi yakalanır. İkisi de uçan kale içine hapsedilmişlerdir. Şimdi Ash ve arkadaşları doğadaki dengesizliklerin nelere sebep olabileceğini anlarlar ve görevleri kuşları onları esir edenden kurtarmak olarak değiştirirler.

Ash ve arkadaşları Team Rocket ’in de yardımıyla kaleye , efsanevi kuşların tutulduğu yere ulaşırlar. Elktrikli alanda alıkonmuş, hapsolmuşlardır. Çete, pokemonlarının saçma davranışlarını gözlemlerken, efsanevi kuşlar arasındaki dengesizliğin, pokemonların davranışlarını etkilediğini farkederler. Aynı zamanda Prof.Oak da aynı şeyi dünyanın diğer ucunda korkmuş onca insanın üzerinde denemektedir. Ash ve çetesi efsanevi kuşları özgür bırakmayı başarırlar. Kuşlar, korkmuş ve şaşırmış olduklarından daha kaleyi terketmeden önce Ash’le arkadaşlarına saldırırlar. Kaleden çıkar çıkmaz Zapados ve Moltres Articuno ile karşılaşırlar. Üç efsanevi kuş dev gibi bir girdap oluşturarak oradan uzaklaşırlar.
 
Denizde oluşan girdabın tepesinde Lugia belirir. Furura onlara Lugia’dan ve onun varlığının dünyanın sonuna işaret ettiğinden söz eder. Ash Lugia’ya doğru uçup Jirarudan’ın onu yakalama planları konusunda onu uyarmaya çalışır. Lugia Ash’in uyarısını görmezden gelir ancak Hikoukyu’ya saldırmadan önce Ash’in gitmesine izin verir. Ancak Jirarudan bunun için hazırlıklıdır ve Lugia’ya kuşları yakalamakta da kullandığı elektirkle kaplı bir kafes fırlatır. Lugia nakavt olmuş, denize düşmüştür. Ardından iyileşir ve Hikoukyu’yu yok edene kadar kuşlarla saldırısına devam eder.
 
Ash denize düşer ama küçük sallarındaki Team Rocket tarafından dışarı çekilir. Misty, Furura ve Kenij kıyıya çıkıp mücadeleyi ordan izlerler. Furura Lugia’nın sadece Hikoukyu’yu yok etmekle kalmayacağını bilyordu. Serbest bırakılırsa dünyayı yerle bir edecekti. Lugia’yı tuzağa düşürmenin tek yolu Furura’nın okarinasını (nefesli bir çalgı) ve bir Master Ball kullanarak onu oraya hapsetmekti. Ash, Furura ve Efsanevi Kuş’ların yardımıyla Lugia’yı tuzağa düşürüp Master ball’un içine hapseder ve bir kez daha günü kurtarır.

Aktif Pokémon: Diğer Pokémonlarınızın önünde yer alan Pokémon. Sadece Aktif Pokémon saldırıda bulanabilir.
Eklemek: Elinizdeki kartlardan birini oyuna dahil bir Pokémonun üzerine eklemek.

Saldır: 
1. Aktif Pokémonunuzun rakibinizin Savunma Pokémonuyla savaşması. 
2. Her bir Pokémonun üzerinde yazılı olan ve saldırdığı zaman ne olacağını belirten açıklama (Bir Pokémonda bir yada iki saldırı yazılı olabilir)
Temel Enerji Kart: Bir OT , ATEŞ , SU   , YILDIRIM , BİLGİÇ , ya da SAVAŞAN   Enerji Kartı.

Temel Pokémon Kartı: Sıra sizdeyken elinizden oynayarak bir Pokémonu oyuna sokmak için kullandığınız kart. Bakınız Değişme kartı.

Yedek Kulübesi: Pokémonunuz oyundayken ancak aktif olarak savaşmazken burada oturur. Aktif Pokémonunuz geri çekilirse ya da Devrilirse bu Pokémonlar savaşa katılır.

Hasar: Bir Pokémon başka bir Pokémona saldırırsa rakibinde hasar yaratır. Bir Pokémonun uğradığı hasar Kabul Edilebilir Hasar Miktarından fazlaysa Devrilerek oyun dışı kalır.

Savunma Pokémonu: Rakibinizin sizin saldırınız sırasında kullandığı Aktif Pokémon.

Atılan Kartlar: Oyundan attığınız kartlar destesi. Bu kartlar her zaman yüzü görünecek şekilde çevrilmelidir. İsteyen istediği anda bu kartlara bakabilir.

Enerji Kartı: Bu kartlar Pokémonunuza güç vererek saldırıya geçmelerini sağlar.

Değişme Kartı: Daha da kuvvetli olması için bir Temel Pokémon kartı üzerine koyabileceğiniz kart (ya da bazen başka bir Değişme kartının da üzerine koyabilirsiniz)

Kabul Edilebilir Hasar Miktarı: Bir Pokémonun Devrilerek oyun dışı kalmadan önce ne kadar hasar almaya tolerans göstereceğini belirten rakam.

Oyuna Dahil: Masadaki kartlarınız oyuna dahildir. Temel Pokémon, Değişme kartları ve Enerji kartları oyuna dahil değilseler kullanılamazlar. (Destenizdeki kartlar, attığınız kartlar ve Ödüllerinin oyuna dahil olarak kabul edilmezler ancak Yedek Kulübesindeki Pokémonlarınız oyuna dahildir.)

Devrilmek: Bir Pokémon Kabul Edilebilir Hasar Miktarına eşit ya da daha fazla hasar almışsa Devrilmiş sayılır.  O Pokémon beraberindeki ekli kartlarla beraber atılmış kartlar destesine gider.Rakibinizin Pokémonlarından biri Devrildiği zaman Ödüllerinizden bir tanesini kazanırsınız.

Pokémon: Pokémon kart değiş tokuş oyununda sizin için savaşan renkli yaratıklar. Oyunda Temel Pokémon ve Değişme Kartları olarak yer alırlar.

Ödüller: Oyunun başında kapalı olarak koyduğunuz 6 karta verilen addır. Rakibinizin Pokémonlarından birini Devrilerek her oyun dışı kalışında Ödüllerden birini elinize alırsınız. Son Ödülü de kazandığınızda oyunu da kazanmış olursunuz.

Dayanıklılık: Bir Pokémonda dayanıklılık özelliği varsa bazı tip Pokémonlar tarafından saldırıldığında 30 hasar daha az hasar alır. Dayanıklılık özelliği kartın alt tarafında ortada belirtilmiştir.

Geri Çekilme: Aktif Pokémonunuzu Yedek Kulübesindeki bir Pokémonla değiştirmek. Geri çekilmek için çekilen Pokémon Enerji kartından geri çekilme fiyatına eşit bir miktarı atmanız gerekir. Bu fiyat kartın sağ alt tarfından yazılıdır.

Ani Ölüm: (Sudden Death) Bazen iki oyuncu birden aynı anda kazanabilir. Bu durumda "Ani Ölüm" adı verilen son derece kısa bir Pokémon oyununu oynarsınız. (Normal 6 Ödül yerine 1 Ödül.)

Eğitimci Kartları: Sıra sizdeyken bu kartlardaki talimatları yerine getirerek oynadıktan sonra bu kartları atarsınız.

Zayıflık: Bir Pokémon Zayıflık özelliğine sahipse bazı tip Pokémonlar tarafından saldırıya uğradığında iki kat hasar alır. Zayıflık kartın sol alt tarafında yazılıdır.